醫療器材包羅萬象，除在臨床的醫療設備外，並更普及於日常生活中的輔具科技。為培育學生具備醫療器材專業之基本知識與技術技能，本系特設置不同專業選修模組課程供學生修讀，強化其醫療器材專業技術能力。因應時勢脈動與全球發展趨勢，不同學年度入學新生之修讀模組與核心課程略有微調，學生應以該入學年度之最新修訂科目總表與新舊課程對照表之資訊為主。不論選擇哪一類模組，學生皆會受到本系專業教師的指導，對於未來銜接就業或升學皆是很好的培訓。

112學年度：

課程架構區分為【智慧醫療類】及【醫療器材應用類】

111學年度：

課程架構區分為【智慧醫療類】及【醫療器材應用類】

110學年度：

【生醫電子與影像模組】核心課程：訊號分析實務、醫學影像技術與產業應用、電腦輔助電路設計、數位電路與單晶片設計。 [共4門核心課程]

【智慧型輔助科技模組】核心課程：可程式邏輯控制實務、自動化工程與設備實務、人因工程設計與實務、智慧型照護輔具應用實務。 [共4門核心課程]

109學年度：

【生醫電子與影像模組】核心課程：訊號分析實務、醫學影像技術與產業應用、電腦輔助電路設計、數位電路與單晶片設計。 [共4門核心課程]

【智慧型輔助科技模組】核心課程：可程式邏輯控制實務、自動化工程與設備實務、人因工程設計與實務、智慧型照護輔具應用實務。 [共4門核心課程]

108學年度：

【生醫電子與影像模組】核心課程：感測器實務、訊號分析實務、醫學影像技術與產業應用、數位電路與單晶片設計。 [共4門核心課程]

【智慧型輔助科技模組】核心課程：人因工程設計與實務、可程式邏輯控制實務、智慧型照護輔具應用實務、自動化工程與設備實務。 [共4門核心課程]

106與107學年度：

【生醫工程模組】核心課程：生醫訊號原理與量測、數位電路與單晶片設計、醫療設備安全與法規、生醫材料、材料力學、智慧型照護輔具應用實務。 [共6門核心課程]

【智慧自動化模組】核心課程：生醫虛擬儀控、可程式邏輯控制實務、自動化工程與設備實務、電工設計。 [共4門核心課程]